第137回日本森林学会大会 発表検索
講演詳細
遺伝・育種部門[Forest Genetics and Tree Breeding]
| 日付 | 2026年3月17日 |
|---|---|
| 開始時刻 | ポスター発表 |
| 会場名 | 多目的ホール |
| 講演番号 | PF-7 |
| 発表題目 | コハウチワカエデの遺伝的多様性と集団遺伝構造の解明 Genetic diversity and population genetic structure in Acer sieboldianum |
| 所属 | 名古屋大学 |
| 要旨本文 | 一塩基多型（SNP）はゲノム全域に分布するため、ゲノムワイドな多数のSNPを用いることにより、種内の遺伝的多様性や集団遺伝構造の高精度な推定が可能であると考えられる。MIG-seq法はSNPを検出する手法の1つであり、次世代シーケンサーを用いてSNPを迅速・簡便・安価に検出することができる。特に、従来は解析が難しかった微量・低品質なDNAサンプルでも解析可能な点に特徴がある。コハウチワカエデは、北海道と沖縄を除く日本の冷温帯落葉広葉樹林に広く分布する固有種である。本研究では、コハウチワカエデを対象として種内の遺伝的多様性と集団遺伝構造を明らかにすることを目的とした。分布全域にわたる18集団から計165個体の葉を採取し、DNAを抽出し、MIG-seq法でSNPを検出してフィルタリングを行なった結果、536座のSNPの遺伝子型が得られた。このデータを用いて集団遺伝学的解析を行なったところ、集団内の遺伝的多様性には地理的傾向が見られなかったが、中四国地方を境に北東と南西のクラスターに分かれる遺伝構造が明らかになった。 |
| 著者氏名 | ○富岡楓1 ・ 岩瀬友秀2 ・ 赫英紅3 ・ 陶山佳久3 ・ 戸丸信弘2 |
| 著者所属 | 1名古屋大学農学部 ・ 2名古屋大学大学院生命農学研究科 ・ 3東北大学大学院農学研究科 |
| キーワード | MIG-seq, 一塩基多型, 遺伝的分化, 遺伝的構造, 系統地理 |
| Key word | MIG-seq, single nucleotide polymorphism, genetic differentiation, genetic structure, phylogeography |